Endodoncie spočívá v důkladném odstranění celého kazu a nevyhovující plomby. Poté se zubní lékař provrtá do dřeňové dutiny a nalezne vstupy do kořenových kanálků. Po odstranění nervu a důkladném výplachu desinfekčním prostředkem se změří délky jednotlivých kk. pomocí elektrometrického přístroje, popř. rentgenu.
Následuje opracování, rozšíření a desinfekce kanálků na požadovanou délku. Tímto způsobem se eliminuje veškerá infekce a kanálky se zprůchodní natolik, aby je bylo možné poté co nejadekvátněji zaplnit. Opracování se provádí pomocí ručních a strojových nikl-titanových nástrojů.
Plnit lze několika způsoby, nejčastěji pomocí tenkých gutaperčových čepů. Gutaperča je materiál podobný kaučuku, jedná se o zaschlou šťávu ze stromu Isonandra gutta.
Po endodontickém ošetření by měl být zub opatřen polokorunkou nebo korunkou (záleží na zbytku zachovalých tvrdých zubních tkáních).